中国企业在日本投资，一般通过以下三种方式：
设立驻日事务所
设立支店
设立日本法人
关于在日本设立驻日事务所，在法律上没有类似日本法人成立以及日本支店设立的规定。通过购买房地产或者房屋租赁合同，确保事务所的场所，设立事务所后，驻日事务所的设立也就完成。
在日本设立支店的一般步骤如下：
1.部分业界需向日本银行提交外汇法上支店设立报告书；2.整理设立日本支店注册申请事项；3.公司名称调查；4.设立支店；5.指定“声明书”；6.在日大使馆或领事馆认证“声明书”；7.法务局支店设立申请；8.获取公司登记事项证明；9.开设银行账户
中国企业在日本设立日本法人时，一般选择设立股份有限公司或者有限责任公司。
中国企业除了自己设立股份有限公司或有限责任公司之外，也可以通过和日本本地的企业或投资公司合作，设立合作/合伙企业。这也是迅速拓展日本市场的中国企业对日投资的方式之一。